Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Herpud1Q9JJK5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms