Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms