Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1Q9JIT0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms