Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Chrnb2Q9ERK7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrnb2Q9ERK7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms