Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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