Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sil1Q9EPK6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms