Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pop7Q9DCH2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop7Q9DCH2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms