Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Asf1bQ9DAP7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms