Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D5Q8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D5Q8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms