Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem30cQ9D4D7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem30cQ9D4D7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms