Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Obox1Q9D350 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms