Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1cQ9D300 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1cQ9D300 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1cQ9D300 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1cQ9D300 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1cQ9D300 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1cQ9D300 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1cQ9D300 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rasgef1cQ9D300 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rasgef1cQ9D300 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rasgef1cQ9D300 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rasgef1cQ9D300 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms