Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krtap5-3Q9D226 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krtap5-3Q9D226 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms