Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms