Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms