Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdca4Q9CWM2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms