Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BccipQ9CWI3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms