Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sppl3Q9CUS9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms