Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rab5aQ9CQD1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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