Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcg3Q99P81 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcg3Q99P81 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms