Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms