Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnaja3Q99M87 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms