Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prpf19Q99KP6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms