Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Reep3Q99KK1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms