Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms