Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RttnQ8R4Y8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RttnQ8R4Y8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms