Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vrk3Q8K3G5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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