Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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