Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip10Q8CJ53 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip10Q8CJ53 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms