Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms