Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms