Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn3Q8CBC6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lrrn3Q8CBC6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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