Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms