Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctxn3Q8BXZ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctxn3Q8BXZ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms