Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Cldn17Q8BXA6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn17Q8BXA6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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