Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zcchc4Q8BKW4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms