Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg2bQ80XK6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2bQ80XK6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms