Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcdh8Q7TSK3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcdh8Q7TSK3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms