Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RfflQ6ZQM0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RfflQ6ZQM0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RfflQ6ZQM0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms