Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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