Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Opn5Q6VZZ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn5Q6VZZ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn5Q6VZZ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Opn5Q6VZZ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn5Q6VZZ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn5Q6VZZ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn5Q6VZZ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn5Q6VZZ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn5Q6VZZ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Opn5Q6VZZ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms