Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms