Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nudcd1Q6PIP5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nudcd1Q6PIP5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms