Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc36Q6PDM4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms