Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg2aQ6P4T0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms