Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm2bQ6P1G2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm2bQ6P1G2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms