Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asic1Q6NXK8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms