Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zic2Q62520 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zic2Q62520 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms