Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JrkQ60976 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JrkQ60976 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms