Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc125Q5U465 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms